Summary
Physics
Debian Med-pakker for medicinske fysikere
Denne metapakke indeholder afhængigheder for en samling af programmer og
dokumentation, som er nyttige for medicinske fysikere indenfor
strålingsonkologi, diagnostik billedbehandling og relaterede felter.
Description
For a better overview of the project's availability as a Debian package, each head row has a color code according to this scheme:
If you discover a project which looks like a good candidate for Debian Med
to you, or if you have prepared an unofficial Debian package, please do not hesitate to
send a description of that project to the Debian Med mailing list
Links to other tasks
|
Debian Med Physics packages
Official Debian packages with high relevance
biosig-tools
Konverteringsværktøjer for biomedicinske dataformater
|
Versions of package biosig-tools |
Release | Version | Architectures |
trixie | 2.6.1-1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x |
bullseye | 2.1.2-4 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
bookworm | 2.5.0-1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
jessie | 1.3.0-2 | amd64,armel,armhf,i386 |
sid | 2.6.1-1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x |
stretch | 1.3.0-2.2 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
buster | 1.9.3-2 | amd64,arm64,armhf,i386 |
Debtags of package biosig-tools: |
interface | commandline |
role | program |
use | converting |
|
License: DFSG free
|
Baseret på BioSig-biblioteket tilbyder denne pakke værktøjer for
kommandolinjen, såsom:
- save2gdf: konverteringsprogram mellem forskellige filformater,
inklusive men ikke begrænset til CP-ECG(EN1064), HL7aECG (FDA-XML),
GDF, EDF, BDF, CWFB
- biosig2gdf: konverterer biosig-datafiler til GDF, for at forenkle
fortolkning og indlæsning af skriptsprog (f.eks. loadgdf.{py,r})
- rec2bin, bin2rec, heka2itx, save2aecg, save2scp: flere
konverteringsværktøjer baseret på save2gdf
- biosig_fhir: pakker biosignal-data til HL7/FHIR-binær skabelonfil
- physicalunits: konverteringsprogram til at kode og afkode fysiske
enheder jævnfør ISO 11073-10101
|
|
gdf-tools
IO-bibliotek for GDF'en - hjælpeværktøjer
|
Versions of package gdf-tools |
Release | Version | Architectures |
bullseye | 0.1.3-8 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
stretch | 0.1.2-2 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
jessie | 0.1.2-2 | amd64,armel,armhf,i386 |
buster | 0.1.2-2.1 | amd64,arm64,armhf,i386 |
bookworm | 0.1.3-11 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
trixie | 0.1.3-11.1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x |
sid | 0.1.3-11.1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x |
Debtags of package gdf-tools: |
role | program |
|
License: DFSG free
|
GDF (General Dataformat for Biosignals) er lavet for at tilbyde et generisk
lager for biosignaler, såsom EEG, ECG, MEG etc.
Denne pakke tilbyder værktøjet leveret med biblioteket (gdf_merger).
|
|
octave
GNU Octave-sprog til talberegninger
|
Versions of package octave |
Release | Version | Architectures |
bullseye | 6.2.0-1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
sid | 9.2.0-3 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x |
trixie | 9.2.0-3 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x |
bookworm | 7.3.0-2 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
buster-backports | 5.2.0-3~bpo10+1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
buster | 4.4.1-5 | amd64,arm64,armhf,i386 |
stretch-backports | 4.4.1-4~bpo9+1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips,mips64el,mipsel,ppc64el |
stretch-backports | 4.4.0-3~bpo9+1 | s390x |
stretch | 4.0.3-3 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
jessie | 3.8.2-4 | amd64,armel,armhf,i386 |
Debtags of package octave: |
field | mathematics |
role | program |
suite | gnu |
|
License: DFSG free
|
Octave er et (for det meste Matlab®-kompatibelt) sprog på højt niveau, primært beregnet til numeriske beregninger. Programmet tilbyder en nem brugerflade fra kommandolinjen til løsning af lineære og ikkelineære problemer numerisk.
Octave kan udvides dynamisk med filer i C++ som leveres af brugeren.
|
|
paw
Fysikanalyse Arbejdsstation - et grafisk analyseprogram
|
Versions of package paw |
Release | Version | Architectures |
stretch | 2.14.04.dfsg.2-9.1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
buster | 2.14.04.dfsg.2-9.1 | amd64,arm64,armhf,i386 |
jessie | 2.14.04.dfsg.2-9 | amd64,armel,armhf,i386 |
Debtags of package paw: |
field | physics |
interface | x11 |
role | program |
scope | utility |
uitoolkit | xlib |
use | viewing |
x11 | application |
|
License: DFSG free
|
CERNLIB er en kontorpakke af dataanalyseværktøjer og biblioteker oprettet
til brug for fysiske eksperimenter, men også for programmer på andre
felter så som de biologiske videnskaber.
PAW er et interaktivt program som muliggør interaktive grafiske
præsentationer, statistiske og matematiske analyseværktøjer. Det er
designet til at fungere på objekter som er kendte for fysikere så som
histogrammer, begivenhedsfiler (Ntuples), vektorer, etc.
Programmet er koblet statisk mod CERN-biblioteket på 64-bit arkitekturer
for at fungere korrekt, da det ikke er særlig 64-bit renset.
|
|
paw++
Physics Analysis Workstation (Lesstif-forbedret version)
|
Versions of package paw++ |
Release | Version | Architectures |
buster | 2.14.04.dfsg.2-9.1 | amd64,arm64,armhf,i386 |
stretch | 2.14.04.dfsg.2-9.1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
jessie | 2.14.04.dfsg.2-9 | amd64,armel,armhf,i386 |
Debtags of package paw++: |
field | physics |
interface | x11 |
role | program |
scope | utility |
uitoolkit | motif |
use | viewing |
x11 | application |
|
License: DFSG free
|
CERNLIB er en kontorpakke af dataanalyseværktøjer og biblioteker oprettet
til brug for fysiske eksperimenter, men også for programmer på andre
felter såsom de biologiske videnskaber.
Denne pakke inkluderer Paw++, et interaktivt program til brug i analyse og
grafiske præsentationer. Paw++ er det samme program som PAW (i pakken
paw), men med en mere brugervenlig Motif-baseret grafisk brugerflade,
kompileret mod Lesstif i Debian.
Programmet er lænket statistisk mod CERN-bibliotekerne på 64-bit
arkitekturer for at fungere korrekt, da dets design ikke er særlig rettet
mod 64-bit.
|
|
r-base
GNU R statistisk beregning og grafiksystem
|
Versions of package r-base |
Release | Version | Architectures |
buster | 3.5.2-1 | all |
stretch | 3.3.3-1 | all |
bullseye | 4.0.4-1 | all |
bookworm | 4.2.2.20221110-2 | all |
trixie | 4.4.1-3 | all |
sid | 4.4.1-3 | all |
jessie | 3.1.1-1+deb8u1 | all |
jessie-security | 3.1.1-1+deb8u1 | all |
Debtags of package r-base: |
devel | lang:r |
field | statistics |
role | dummy, metapackage |
suite | gnu |
|
License: DFSG free
|
R er et system til statistisk beregning og grafik. Det består af et sprog
plus et afviklingsmiljø med grafik, et aflusningsredskab, adgang til
særlige systemfunktioner, samt evnen til at køre programmer som er gemt
som skriptfiler.
Designet af R er tungt påvirket af to eksisterende sprog: Becker, Chambers
& Wilks' S og Sussman's Scheme. Hvor sprogudformningen i sin fremtræden i
høj grad ligner S, så er den underliggende implementering og semantik
afledt fra Scheme.
Kernen i R er et fortolket programmeringssprog som tillader forgrening og
løkker, så vel som modulær programmering med brug af funktioner. De fleste
funktioner som er synlige for brugeren i R er skrevet i R. Det er muligt
for brugeren at tilgå procedurer skrevet i C, C++ eller FORTRAN sprogene
for effektivitet, og mange af R's kernefunktioner gør dette.
Distributionen R indeholder funktionalitet til et stort antal statistiske
procedurer og underliggende anvendte matematiske beregninger. Der er også
et stort sæt af funktioner, der tilbyder et grafisk miljø til oprettelse
af adskillige slags datarepræsentationer.
Derudover er flere tusinde udvidelsespakker tilgængelige fra CRAN
(Comprehensive R Archive Network), mange også som Debianpakker, der er
navngivet »r-cran-«.
Disse pakker er en metapakke, som letter overgangen fra
pre-1.5.0-pakkestrukturen med dennes store r-base-pakke. Så snart den er
installeret, kan den uden videre fjernes og apt-get vil automatisk
opgradere dens komponenter under fremtidige opgraderinger. Denne pakke gør
det muligt for brugerne kun at installere r-base-core, hvis de ønsker det.
|
|
Official Debian packages with lower relevance
libbiosig-dev
I/O-bibliotek for biomedicinske data - udviklingsfiler
|
Versions of package libbiosig-dev |
Release | Version | Architectures |
trixie | 2.6.1-1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x |
stretch | 1.3.0-2.2 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
jessie | 1.3.0-2 | amd64,armel,armhf,i386 |
buster | 1.9.3-2 | amd64,arm64,armhf,i386 |
sid | 2.6.1-1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x |
bullseye | 2.1.2-4 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
bookworm | 2.5.0-1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
Debtags of package libbiosig-dev: |
devel | examples, library |
role | devel-lib |
|
License: DFSG free
|
BioSig er et bibliotek for adgang til filer i flere forskellige
biomedicinske dataformater (inklusive EDF, BDF, GDF, BrainVision, BCI2000,
CFWB, HL7aECG, SCP_ECG (EN1064), MFER, ACQ, CNT(Neuroscan), DEMG, EGI,
EEG1100, FAMOS, SigmaPLpro, TMS32). Den fulde liste over understøttede
filformater er tilgængelig på http://pub.ist.ac.at/~schloegl/biosig/TESTED .
Denne pakke tilbyder hovedfiler og det statiske bibliotek.
|
|
octave-biosig
Octavebindinger for BioSig-biblioteket
|
Versions of package octave-biosig |
Release | Version | Architectures |
bookworm | 2.5.0-1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
bullseye | 2.1.2-4 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
trixie | 2.6.1-1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x |
buster | 1.9.3-2 | amd64,arm64,armhf,i386 |
stretch | 1.3.0-2.2 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
jessie | 1.3.0-2 | amd64,armel,armhf,i386 |
sid | 2.6.1-1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x |
|
License: DFSG free
|
Denne pakke tilbyder Octavebindinger for BioSig-biblioteket. Primært formål
er en I/O-grænseflade til en række biomedicinske filformater, inklusive men
ikke begrænset til SCP-ECG(EN1064), HL7aECG (FDA-XML), GDF, EDF.
|
|
paw-demos
Physics Analysis Workstation - eksempler og test
|
Versions of package paw-demos |
Release | Version | Architectures |
jessie | 2.14.04.dfsg.2-9 | all |
stretch | 2.14.04.dfsg.2-9.1 | all |
buster | 2.14.04.dfsg.2-9.1 | all |
Debtags of package paw-demos: |
devel | examples, testing-qa |
field | physics |
interface | commandline, x11 |
role | program |
x11 | application |
|
License: DFSG free
|
CERNLIB er en kontorpakke af dataanalyseværktøjer og biblioteker oprettet
til brug for fysiske eksperimenter, men også for programmer på andre
felter såsom de biologiske videnskaber.
Denne pakke inkluderer nogle skripter for brug af PAW eller Paw++ og
testskripter for at sikre, at PAW- eller Paw++-programmer opfører sig
korrekt. Du kan køre eksemplerne og test med det inkluderede paw-demos-program.
|
|
python3-biosig
Python 3-bindinger for BioSig-biblioteket
|
Versions of package python3-biosig |
Release | Version | Architectures |
sid | 2.6.1-1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x |
bookworm | 2.5.0-1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
bullseye | 2.1.2-4 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
buster | 1.9.3-2 | amd64,arm64,armhf,i386 |
trixie | 2.6.1-1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x |
|
License: DFSG free
|
Denne pakke tilbyder Python 3-bindinger for BioSig-biblioteket. Primære
formål - I/O-grænseflade til en række biomedicinske filformater, inklusive
men ikke begrænset til SCP-ECG(EN1064), HL7aECG (FDA-XML), GDF, EDF.
|
|
python3-multipletau
multiple-tau algorithm for Python3/NumPy
|
Versions of package python3-multipletau |
Release | Version | Architectures |
sid | 0.4.1+ds-1 | all |
trixie | 0.4.1+ds-1 | all |
bookworm | 0.3.3+ds-4 | all |
jessie | 0.1.4-1 | all |
stretch | 0.1.7+ds-1 | all |
bullseye | 0.3.3+ds-3 | all |
buster | 0.3.3+ds-1 | all |
|
License: DFSG free
|
Multiple-tau correlation is computed on a logarithmic scale (less
data points are computed) and is thus much faster than conventional
correlation on a linear scale such as numpy.correlate
An online reference is available
at http://paulmueller.github.io/multipletau
|
|
No known packages available but some record of interest (WNPP bug)
Geant4 Application for Emission Tomography
|
|
License: LGPL
Debian package not available
|
GATE incorporates the Geant4 libraries in a modular, versatile, and
scripted simulation toolkit which is adapted to the field of nuclear
medicine both in PET (Positron Emission Tomography) and SPECT (Single
Photon Emission Computer Tomography). It allows the accurate description
of time-dependent phenomena such as source or detector movement and
source decay kinetics. The ability to synchronize all time-dependent
components allows a coherent description of the acquisition process. It
makes it possible to perform realistic simulations of data acquisitions
in time.
|
platform for the design, test and use of BCI
|
|
License: LGPL
Debian package not available
Language: C++
|
OpenViBE enables to design, test and use Brain-Computer Interfaces (BCI).
OpenViBE is a software for real-time neurosciences (that is, for
real-time processing of brain signals). It can be used to acquire, filter,
process, classify and visualize brain signals in real time.
|
|