Debian Med Psychology packages

This package installs a plugin for Orthanc, the lightweight, RESTful Vendor Neutral Archive for medical imaging. This plugin adds support for neuroimaging in Orthanc, notably to easily convert from DICOM to NIfTI.

Według autorów, praat służy do obsługiwania komputerowej fonetyki. Za pośrednictwem interfejsu graficznego można uzyskać dostęp do różnych funkcji analizy mowy, dostępne są: spektrogramy, kochleogramy, wydobywanie intensywności i formatu dźwięku. Program umożliwia również syntezę artykulacji, intensywności, formatu oraz intonacji. Pozostałe funkcje to: segmentacja, znakowanie z wykorzystaniem alfabetu fonetycznego i obliczanie statystyk. Praat jest konfigurowalny i rozszerzalny poprzez własny język skryptowy, a ponadto potrafi komunikować się z innymi programami.

Psignifit allows fitting of psychometric functions to datasets while maintaining full control over a large number of parameters. Data can either be read from text files or passed through a pipe.

Psignifit performs the calculation of confidence intervals as well as goodness-of-fit tests.

This is the command line version.

Please note: This is the legacy version 2.x of psignifit.

PsychoPy udostępnia środowisko do tworzenia bodźców psychologicznych przy użyciu języka skryptowego Python. PsychoPy łączy w sobie zalety graficzne OpenGL z łatwą składnią języka Python, aby zapewnić psychofizykom darmowy i prosty pakiet do kontroli i prezentacji bodźców.

Jego celem jest dostarczenie zapracowanym naukowcom narzędzi do kontroli czasu i okien oraz prostego zestawu gotowych bodźców i metod. Właściwości PsychoPy:

• środowisko IDE GUI do kodowania w potężnym języku skryptowym (Python);
• narzędzie Builder GUI do szybkiego opracowywania sekwencji stymulacji;
• korzystanie z grafiki z akceleracją sprzętową (OpenGL);
• integracja ze Spectrascan PR650 w celu łatwej kalibracji monitora;
• proste procedury dla klatki schodowej i stałych bodźców eksperymentalnych;
• metody takie jak curve-fitting i bootstrapping;
• proste (lub złożone) interfejsy graficzne za pośrednictwem wxPython;
• Łatwe w użyciu interfejsy do joysticków, myszy, kart dźwiękowych itp. poprzez PyGame;
• odtwarzanie wideo (MPG, DivX, AVI, QuickTime itp.) w roli bodźca.

BioXTAS RAW is a GUI based, Python program for reduction and analysis of small-angle X-ray solution scattering (SAXS) data. The package is designed for biological SAXS data.

BioXTAS RAW provides an alternative to closed source programs such as Primus and Scatter for primary data analysis. Because it can calibrate, mask, and integrate images it also provides an alternative to synchrotron beamline pipelines that scientists can install on their own computers and use both at home and at the beamline.

Pakiet udostępnia funkcje umożliwiające odczyt i zapis danych przechowywanych w pakietach statystycznych, takich jak: Minitab, S, SAS, SPSS, Stata itd.

Pakiet jest częścią zestawu pakietów "zalecanych" przez R Core i dostarczanych z wersjami źródłowymi samego R.

Pakiet zawiera szereg procedur stosowanych w psychometrii i skalowaniu:

• Kappa Cohena i Kappa ważona (testy zgodności dwóch osób);
• Alfa Cronbacha (test niezawodności pozycji);
• Focused Principal Components Analysis (Skoncentrowana analiza głównych komponentów);
• Współczynniki korelacji wewnątrzklasowej;
• Kappa Lighta (test zgodności N-rater);
• Wykresy ekranowe i graficzne reprezentacje głównych komponentów.

This GNU R package provides a general purpose toolbox for personality, psychometric theory and experimental psychology. Functions are primarily for multivariate analysis and scale construction using factor analysis, principal component analysis, cluster analysis and reliability analysis, although others provide basic descriptive statistics. Item Response Theory is done using factor analysis of tetrachoric and polychoric correlations. Functions for analyzing data at multiple levels include within and between group statistics, including correlations and factor analysis. Functions for simulating and testing particular item and test structures are included. Several functions serve as a useful front end for structural equation modeling. Graphical displays of path diagrams, factor analysis and structural equation models are created using basic graphics. Some of the functions are written to support a book on psychometric theory as well as publications in personality research.

Contains GNU R functions useful for correlation theory, meta-analysis (validity-generalization), reliability, item analysis, inter-rater reliability, and classical utility.

Recursive partitioning based on psychometric models, employing the general MOB algorithm (from package partykit) to obtain Bradley-Terry trees, Rasch trees, rating scale and partial credit trees, and MPT trees.

An assortment of functions that could be useful in analyzing data from psychophysical experiments. It includes functions for calculating d' from several different experimental designs, links for m-alternative forced- choice (mafc) data to be used with the binomial family in glm (and possibly other contexts) and self-Start functions for estimating gamma values for CRT screen calibrations.

PyEPL jest zestawem narzędzi do przesyłania bodźców i rejestrowania reakcji, który może być używany do tworzenia psychologicznych eksperymentów (a także do neurologii, badań marketingowych, i innych).

Zapewnia:

• prezentacje: zarówno bodźców wzrokowych jak i słuchowych;
• rejestrowanie reakcji: zarówno manualnej (klawiatura/joystick) jak i dźwiękowej (mikrofon) z sygnaturą czasową;
• synchronizację impulsową: synchronizowanie behawioralnych zadań z zewnętrznego sprzętu rejestrującego;
• elastyczność kodowania najróżniejszych eksperymentów ze względu na użycie Pythona jako języka opisującego;
• szybka realizacja krytycznych punktów z powodu wywołań do połączonych skompilowanych bibliotek.

Celem tego zestawu narzędzi jest ustanowienie alternatywy dla powszechnie stosowanego komercyjnego programu E (E-Prime).

Pakiet zawiera PyEPL do obsługiwanych wersji Pythona.

This package contains a Python module to validate BIDS (Brain Imaging Data Structure) datasets. It does not contain original bids-validator command line tool (written in JS).

The brain modelling toolkit is a software development package for building, simulating and analysing large-scale networks of different levels of resolution.

PyNWB is a Python package for working with NWB files. It provides a high-level API for efficiently working with Neurodata stored in the NWB format.

Neurodata Without Borders: Neurophysiology (NWB:N) is a project to develop a unified data format for cellular-based neurophysiology data, focused on the dynamics of groups of neurons measured under a large range of experimental conditions.

Ten metapakiet instaluje pakiety Debiana, które mogą być przydatne do przeprowadzania dowolnego eksperymentu związanego z bodźcami fizycznymi i ich skutkami psychologicznymi.

Dobór pakietów został ukierunkowany na oprogramowanie do dostarczania bodźców. Dodatkowe oprogramowanie związane z analizą pozyskanych danych odnosi się do nauki-neurologii-poznawczej, obrazowania medycznego w zależności od dziedziny zastosowania. Dodatkowo warto zapoznać się z science-bci, ponieważ często zapewnia kompletne struktury pętli, łącznie z dostarczaniem bodźców.