Debian Med Project
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Summary
Psychology
Debian Med packages for psychology

This metapackage contains dependencies for a collection of software which might be helpful for psychological research.

The list to the right includes various software projects which are of some interest to the Debian Med Project. Currently, only a few of them are available as Debian packages. It is our goal, however, to include all software in Debian Med which can sensibly add to a high quality Debian Pure Blend.

For a better overview of the project's availability as a Debian package, each head row has a color code according to this scheme:

If you discover a project which looks like a good candidate for Debian Med to you, or if you have prepared an unofficial Debian package, please do not hesitate to send a description of that project to the Debian Med mailing list

Links to other tasks

Debian Med Psychology packages

Official Debian packages with high relevance

Praat
Programm zur Sprachanalyse und -synthese
Versions of package praat
ReleaseVersionArchitectures
squeeze5.1.42-1amd64,armel,i386,ia64,mips,mipsel,powerpc,s390,sparc
wheezy5.3.16-1amd64,armel,armhf,i386,ia64,mips,mipsel,powerpc,s390,s390x,sparc
jessie5.3.16-1s390
sid5.3.16-1s390
experimental5.3.35-1s390
jessie5.3.57+dfsg-1ia64,sparc
sid5.3.57+dfsg-1ia64
jessie5.3.82-1amd64,armel,armhf,i386,mips,mipsel,powerpc,s390x
sid5.3.82-1amd64,armel,armhf,i386,mips,mipsel,powerpc,ppc64el,s390x,sparc
upstream5.3.83
Debtags of package praat:
fieldlinguistics
interfacex11
roleprogram
scopeapplication
uitoolkitmotif
works-withaudio
x11application
Popcon: 41 users (9 upd.)*
Newer upstream!
License: DFSG free
Git

Laut den Autoren, macht praat Phonetik durch den Computer (frei übersetzt von »doing phonetics by computer«). Durch die grafische Oberfläche sind verschiedene Funktionalitäten zur Sprachanalyse vorhanden: Spektrogramme, Cochleogramme sowie Pitch- und Formant-Extraktion. Artikulationssythese als auch Synthesen von Pitch, Formant und Intensität sind ebenfalls verfügbar. Andere Fähigkeiten sind Segmentierung, Kennzeichnungen, die die Lautschrift benutzen und Berechnung von Statistiken. Praat ist konfigurier- und durch die eigene Skriptsprache erweiterbar und hat Vorkehrungen, um mit anderen Programmen zu kommunizieren.

Please cite: Paul Boersma: Praat, a system for doing phonetics by computer. Glot International 5(9/10):341-345 (2001)
Psignifit
Anpassung und Test von Hypothesen über psychometrische Funktionen
Versions of package psignifit
ReleaseVersionArchitectures
squeeze2.5.6-3amd64,armel,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390,sparc
wheezy2.5.6-3amd64,armel,armhf,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390,s390x,sparc
jessie2.5.6-3amd64,armel,armhf,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390,s390x,sparc
sid2.5.6-3amd64,arm64,armel,armhf,hurd-i386,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,ppc64el,s390,s390x,sparc
Debtags of package psignifit:
fieldstatistics
interfacecommandline
roleprogram
Popcon: 42 users (7 upd.)*
Versions and Archs
License: DFSG free
Svn

Psignifit ermöglicht die Anpassung psychometrischer Funktionen an Datensätze und erhält dabei gleichzeitig die volle Kontrolle über eine große Anzahl von Parametern. Die Daten können entweder aus Textdateien gelesen oder durch eine Pipeline übergeben werden.

Psignifit berechnet Konfidenzintervalle und testet die Güte der Anpassung.

Dies ist die Kommandozeilenversion.

Psychopy
Umgebung zur Erstellung psychologischer Reize in Python
Versions of package psychopy
ReleaseVersionArchitectures
squeeze1.61.03.dfsg-1all
wheezy1.73.06.dfsg-1all
jessie1.77.02.dfsg-1all
sid1.77.02.dfsg-1all
sid1.79.00+git16-g30c9343.dfsg-1all
upstream1.80.06
Popcon: 20 users (5 upd.)*
Newer upstream!
License: DFSG free
Git

PsychoPy bietet eine Umgebung um psychologische Reize unter Verwendung der Skriptsprache Python zu erstellen. Sie kombiniert die grafischen Stärken von OpenGL mit der einfachen Syntax von Python, um der Psychophysik ein freies und einfaches Präsentations- und Kontrollpaket für Reize bereit zu stellen.

Das Ziel ist es, dem geschäftigen Wissenschaftler Werkzeuge zur Kontrolle von Zeitnehmung und Windowing sowie einen einfachen Satz von vorgefertigten Reizen und Methoden zu liefern. Die Merkmale von PsychoPy:

  • IDE mit grafischer Oberfläche für die Codierung mit einer mächtigen Skriptsprache (Python)
  • grafische Oberfläche für die schnelle Entwicklung von Stimulationssequenzen
  • verwendet hardwarebeschleunigte Grafik (OpenGL)
  • einfache Monitorkalibrierung bei Spectrascan PR650 durch gute Integration
  • einfache Routinen für die Staircase-Methode und die Methode der konstanten Stimuli sowie für Ausgleichsrechnungen und Bootstrapping
  • einfache (oder komplexe) GUIs mittels wxPython
  • einfache Schnittstelle für Joysticks, Mäuse, Soundkarten etc. mittels PyGame
  • Abspielen von Filmen (MPG, DivX, AVI, QuickTime) als Reize
The package is enhanced by the following packages: python-pyoptical
Please cite: J. W. Peirce: PsychoPy - Psychophysics software in Python. (2007)
Screenshots of package psychopy
Python-pyepl
Python-Modul zum Entwurf psychologischer Experimente
Versions of package python-pyepl
ReleaseVersionArchitectures
squeeze1.1.0-3amd64,armel,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390,sparc
wheezy1.1.0-3.1amd64,armel,armhf,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390,s390x,sparc
jessie1.1.0+git12-g365f8e3-1s390
sid1.1.0+git12-g365f8e3-1s390
jessie1.1.0+git12-g365f8e3-2amd64,armel,armhf,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390x,sparc
sid1.1.0+git12-g365f8e3-2amd64,armel,armhf,hurd-i386,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390x,sparc
Debtags of package python-pyepl:
devellang:python
hardwareinput, input:keyboard, input:mouse, video
interfacecommandline, x11
officepresentation
roledevel-lib, program
scopesuite
soundplayer
usemonitor, playing, viewing
works-withpeople
x11application
Popcon: 4 users (4 upd.)*
Versions and Archs
License: DFSG free
Git

PyEPL ist ein Werkzeugsatz für die experimentelle Erfassung von Reizen und Reaktionen. Einsatzmöglichkeiten sind primär der Entwurf psychologischer Untersuchungen, aber auch Probleme z.B. in Neurowissenschaften und Marktforschung können damit untersucht werden.

Er bietet

  • Darstellung: visuelle und auditive Reize
  • mit einem Zeitstempel versehene Erfassung von Reaktionen: sowohl manuell (Tastatur/Joystick) als auch Ton (Mikrofon)
  • Sync-Taktung: Synchronisierung Ihres Verhaltensexperiments mit externer Hardware für die Datenerfassung
  • flexible Codierung verschiedener Experimente durch den Einsatz von Python als Beschreibungssprache
  • schnelle Ausführung zeitkritischer Aufgaben durch Aufruf kompilierter Bibliotheken

Dieser Werkzeugkasten soll eine Alternative für ein weit verbreitetes kommerzielles Produkt E' (E-Prime) sein.

Dieses Paket enthält PyEPL für die unterstützten Python-Versionen.

The package is enhanced by the following packages: python-pyoptical
Python-pypsignifit
psychometric analysis of psychophysics data in Python
Versions of package python-pypsignifit
ReleaseVersionArchitectures
wheezy3.0~beta.20120611.1-1amd64,armel,armhf,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mipsel,powerpc,s390x,sparc
jessie3.0~beta.20120611.1-1amd64,armel,armhf,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390x,sparc
sid3.0~beta.20120611.1-1amd64,armel,armhf,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390x,sparc
Popcon: 3 users (3 upd.)*
Versions and Archs
License: DFSG free
Git

Psignifit allows fitting of psychometric functions to datasets while maintaining full control over a large number of parameters. Psignifit performs the calculation of confidence intervals as well as goodness-of-fit tests. In addition it offers:

  • full Bayesian treatment of psychometric functions including Bayesian model selection and goodness of fit assessment
  • identification of influential observations and outlier detection
  • flexible shape definition of the psychometric function

This package provides the Python bindings.

R-cran-foreign
GNU-R-Paket zum Lesen/Schreiben von anderen Statistiksystemen
Maintainer: Dirk Eddelbuettel
Versions of package r-cran-foreign
ReleaseVersionArchitectures
squeeze0.8.40-1amd64,armel,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390,sparc
wheezy0.8.50-1amd64,armel,armhf,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390,s390x,sparc
jessie0.8.55-1s390
sid0.8.56-1s390
jessie0.8.57-1ia64
jessie0.8.59-1sparc
sid0.8.59-1ia64
jessie0.8.61-1amd64,armel,armhf,i386,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390x
sid0.8.61-1amd64,armel,armhf,hurd-i386,i386,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390x,sparc
Debtags of package r-cran-foreign:
devellang:r, library
fieldstatistics
roleapp-data
suitegnu
useconverting
Popcon: 652 users (336 upd.)*
Versions and Archs
License: DFSG free

Dieses Paket bietet Funktionen für das Lesen und Schreiben von Daten, die von anderen Statistikpaketen wie Minitab, S, SAS, SPSS, Stata, … gespeichert wurden.

Dieses Paket ist Teil des Satzes der Pakete, die von »R Core« empfohlen werden und wird mit Original-Quellcode-Releases von R verteilt.

R-cran-psy
GNU-R-Prozeduren für die Psychometrie
Versions of package r-cran-psy
ReleaseVersionArchitectures
squeeze1.0-2all
wheezy1.0-4all
jessie1.1-1all
sid1.1-1all
Debtags of package r-cran-psy:
devellang:r, library
fieldmedicine, statistics
interfacecommandline
roleshared-lib
scopeutility
useanalysing, viewing
Popcon: 55 users (22 upd.)*
Versions and Archs
License: DFSG free
Svn

Dieses Paket enthält etliche Prozeduren, die in der Psychometrie und bei der Skalierung angewendet werden, unter anderem:

  • Cohens Kappa und gewichtetes Kappa (Test der Übereinstimmung von Einschätzungen zweier Beurteiler)
  • Cronbachs Alpha (ein Test der Itemreliabilität)
  • Fokussierte Hauptkomponentenanalyse
  • Intra-Klassen-Korrelationskoeffizienten
  • Lights Kappa (Test der Übereinstimmung von Einschätzungen von n Beurteilern)
  • Screeplots und grafische Darstellungen von Hauptkomponenten
Remark of Debian Med team: r-cran-psy is orphaned upstream.

Hint to users of statistical psychological software. This package seems to be orphaned upstream. There are several related packages at CRAN for instance. See the list of prospective packages below and drop the Debian Med team a note if you are interested in one of them.

Official Debian packages with lower relevance

Python-visionegg
Python library for 2D/3D visual stimulus generation
Versions of package python-visionegg
ReleaseVersionArchitectures
jessie1.2.1-1ia64,s390,sparc
sid1.2.1-1ia64,s390
jessie1.2.1-2amd64,armel,armhf,i386,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390x
sid1.2.1-2amd64,armel,armhf,hurd-i386,i386,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390x,sparc
Popcon: 1 users (0 upd.)*
Versions and Archs
License: DFSG free
Svn

The Vision Egg is a programming library that uses standard, inexpensive computer graphics cards to produce visual stimuli for vision research experiments.

Please cite: Andrew D. Straw: Vision Egg: An Open-Source Library for Realtime Visual Stimulus Generation. Frontiers in Neuroinformatics 2(4) (2008)
Science-psychophysics
Debian Science packages for Psychophysics
Versions of package science-psychophysics
ReleaseVersionArchitectures
wheezy1.0all
jessie1.0all
sid1.0all
jessie1.1all
sid1.1all
jessie1.2all
sid1.2all
Debtags of package science-psychophysics:
rolemetapackage
suitedebian
Popcon: 4 users (8 upd.)*
Versions and Archs
License: DFSG free
Git

This metapackage will install Debian packages which might be useful for carrying out any experiment relating physical stimuli and their psychological effects.

The selection of packages is targeting software for stimuli delivery. For additional software related to the analysis of the acquired data refer to science-neuroscience-cognitive, med-imaging depending on the domain of application. Additionally look into science-bci since those often provide a complete loop frameworks including stimuli delivery.

Unofficial packages built by somebody else

Miscpsycho
Miscellaneous Psychometric Analyses
License: GPL
Language: R

Miscellaneous functions for psychometric problems

Psych
Procedures for Psychological, Psychometric, and Personality Research
License: GPL2+
Language: R

A number of routines for personality, psychometrics and experimental psychology. Functions are primarily for scale construction using factor analysis, cluster analysis and reliability analysis, although others provide basic descriptive statistics. Functions for simulating particular item and test structures are included. Several functions serve as a useful front end for structural equation modeling. Graphical displays of path diagrams, factor analysis and structural equation models are created using basic graphics. Some of the functions are written to support a book on psychometrics as well as publications in personality research. For more information, see the personality-project.org/r webpage.

Psychometric
Applied Psychometric Theory
License: GPL2+
Language: R

Contains functions useful for correlation theory, meta-analysis (validity-generalization), reliability, item analysis, inter-rater reliability, and classical utility

Psychotree
Recursive Partitioning Based on Psychometric Models
License: GPL2
Language: R

Recursive partitioning based on psychometric models, employing the general MOB algorithm (from package party). Currently, only Bradley-Terry trees are implemented.

Psyphy
Functions for analyzing psychophysical data in R
License: GPL
Language: R

An assortment of functions that could be useful in analyzing data from pyschophysical experiments. It includes functions for calculating d' from several different experimental designs, links for m-alternative forced-choice (mafc) data to be used with the binomial family in glm (and possibly other contexts) and self-Start functions for estimating gamma values for CRT screen calibrations.

*Popularitycontest results: number of people who use this package regularly (number of people who upgraded this package recently) out of 167387