Debian Med Typesetting packages

KiNG (Kinemage, Następna Generacja) jest interaktywnym systemem do tworzenia trójwymiarowej grafiki wektorowej. Obsługuje szereg prymitywów graficznych, co czyni go idealnym narzędziem do różnego rodzaju grafów, wykresów i innych ilustracji; mimo, że pierwotnie został zaprojektowany do wyświetlania wielocząsteczkowych struktur dla biofizycznych badań. KiNG opiera się na Mage, JavaMage oraz na koncepcji "kinemage" (kinetyczne obrazy), aby zapewnić w pełni funkcjonalną aplikację Javy z przyjaznym użytkownikowi interfejsem i zintegrowanymi funkcjami edycji. Plik o rozszerzeniu .jar z programem KiNG można użyć wewnątrz strony internetowej jako aplet lub obiekt Javy, w celu umożliwienia łatwego dostępu do obrazów kinemage albo zarządzania plikami za pośrednictwem przeglądarki.

The biblatex package by Philipp Lehman is becoming the definitive citation management tool for LaTeX users. Biblatex has relied on the venerable BibTeX program only for sorting and generating a very generic .bbl file without any formatting instruction. Everything else is taken care of by biblatex, which provides a powerful and flexible macro interface for authors of citation styles.

Biber offers a large superset of BibTeX functionality for BibLaTeX users. In addition it offers full UTF-8 (Unicode 6.0) capabilities, fully customisable sorting, output to GraphViz to help visualise complex crossrefs, support for remote data sources, structural validation of the data against the (customisable) data model, and a lot more.

Aplikacja do zarządzania bibliograficznymi bazami danych w formacie BibTeX. KBibTeX może być używany jako niezależny program, lub też osadzony w innych aplikacjach KDE (np. jako edytor bibliograficzny w Kile).

KBibTeX może przeszukiwać zasoby online (np. Google Scholar) za pomocą konfigurowalnych adresów URL wyszukiwania. Umożliwia też importowanie kompletnych zestawów danych z NCBI Pubmed. Ponadto, obsługuje tagowanie odniesień za pomocą słów kluczowych i zarządza odniesieniami do plików lokalnych.

Pliki BibTeX mogą być eksportowane do formatu HTML, XML, PDF, PS i RTF przy użyciu wielu stylów cytowania.

qqman is an add-on package for the R statistical environment. This package provides functions for visualizing Genome-Wide Association Studies (GWAS) results using Manhattan plots and Quantile-Quantile plots.

Bibus is a bibliographic database which has been developed with LibreOffice/ OpenOffice.org in mind. It can directly insert citations and format the bibliographic index in an open OpenOffice.org Writer document. The main features are

• hierarchical organization of the references with user-defined keys
• designed for multiuser-environments (share databases between users)
• a search engine supporting live queries
• on-line PubMed access
• import of PubMed (Medline), EndNote/Refer, RIS and BibTeX records.

Bibus will use an SQLite-database by default for storage (via the SQLite3 module available in Python >2.5). But it also supports MySQL-databases. If you want to use a MySQL-database, make sure, that you have the python-mysqldb package installed.