Debian Med Typesetting packages

KiNG (Kinemage, Next Generation) è un sistema interattivo per grafica vettoriale tridimensionale. Gestisce un insieme di primitive grafiche che lo rendono adatto per molti tipi di grafi, disegni e altre illustrazioni, anche se il suo uso primario era la visualizzazione di strutture macromolecolari per la ricerca biofisica. KiNG si basa su Mage, JavaMage e il concetto "kinemage" (immagine cinetica) per fornire un'applicazione Java completa con un'interfaccia utente facile da usare e funzionalità di modifica integrate. Il file jar di KiNG può essere usato in una pagina web come applet Java oppure oggetto Java per promuovere un facile accesso alle "kinemage" o ai file di coordinate da un browser web.

Il pacchetto biblatex di Philipp Lehman sta diventando lo strumento definitivo per la gestione delle citazioni per gli utenti di LaTeX. biblatex ha fatto assegnamento sul vecchio programma BibTeX solamente per ordinare e generare un file .bbl molto generico senza alcuna istruzione di formattazione. Qualsiasi altra cosa è controllata da biblatex, che fornisce un'interfaccia per macro potente e flessibile per gli autori di stili per citazioni.

Biber offre un vasto sovrainsieme delle funzionalità di BibTeX per gli utenti BibLaTeX. Inoltre fornisce funzionalità UTF-8 (Unicode 6.0) complete, ordinamento completamente personalizzabile, uscita su GraphViz per aiutare a visualizzare i riferimenti incrociati complessi, gestione di sorgenti dati remote, validazione strutturale dei dati in funzione del modello dei dati (personalizzabile) e molto altro.

Applicazione per gestire database bibliografici nel formato BibTeX. KBibTeX può essere usata come programma autonomo, ma può anche essere integrata in altre applicazioni KDE (ad esempio come editor bibliografico in Kile).

KBibTeX può interrogare risorse in rete (ad es., Google Scholar) attraverso URL di ricerca personalizzabili. È inoltre capace di importare insiemi di dati completi da NCBI Pubmed. Supporta anche l'etichettatura dei riferimenti con parole chiave e gestisce i riferimenti a file locali.

I file BibTeX possono essere esportati in formato HTML, XML, PDF, PS e RTF usando svariati stili di citazione.

qqman è un pacchetto aggiuntivo per l'ambiente statistico R. Questo pacchetto fornisce funzioni per visualizzare risultati di studi di associazione a livello di tutto il genoma (GWAS, Genome-Wide Association Study) utilizzando grafi Manhattan e Quantile-Quantile.

Bibus is a bibliographic database which has been developed with LibreOffice/ OpenOffice.org in mind. It can directly insert citations and format the bibliographic index in an open OpenOffice.org Writer document. The main features are

• hierarchical organization of the references with user-defined keys
• designed for multiuser-environments (share databases between users)
• a search engine supporting live queries
• on-line PubMed access
• import of PubMed (Medline), EndNote/Refer, RIS and BibTeX records.

Bibus will use an SQLite-database by default for storage (via the SQLite3 module available in Python >2.5). But it also supports MySQL-databases. If you want to use a MySQL-database, make sure, that you have the python-mysqldb package installed.