Debian Med Typesetting packages

KiNG (Kinemage, Next Generation) er et interaktivt system for tredimensionel vektorgrafik. Den understøtter et sæt af grafikprimitiver, som gør det egnet til mange typer af grafer, plot og andre illustrationer; selvom dets første brug var at vise makromolekylære strukturer for biofysisk forskning. KiNG bygger på Mage, JavaMage og »kinemage«-konceptet (kinetisk billede) for at levere et Javaprogram med alle funktioner og en brugervenlig grænseflade samt integrerede redigeringsfunktioner. KiNG-jarfilen kan bruges i en netside som et Javapanelprogram eller Javaobjekt til at fremme nem adgang til kinemages eller koordinere filer fra en internetbrowser.

Pakken biblatex af Philipp Lehman er ved at blive det definitive værktøj for citationshåndtering for LaTeX-brugere. Biblatex har været afhængig af det ærværdige BibTeX-program kun for sortering og oprettelse af en meget generisk .bbl-fil uden nogen formateringsinstruktion. Alt andet håndteres af biblatex, som tilbyder en funktionsrig og fleksibel makrogrænseflade for forfattere af citationsstile.

Biber tilbyder et stort undersæt af BibTeX-funktionalitet for BibLaTeX-brugere. Udover at tilbyde fuld UTF-8-funktioner (Unicode 6.0), fuld tilpasset sortering, uddata til GraphViz for at hjælpe med at visualisere komplekse krydsreferencer, understøttelse for eksterne datakilder, strukturel validering af data mod (den tilpassede) datamodellen og en masse andet.

Bibus er en bibliografisk database, som er blevet udviklet med tanke på LibreOffice/OpenOffice.org. Programmet kan direkte indsætte citationer og formatere det bibliografiske indeks i et åbent dokument i OpenOffice.org Writer. De væsentligste funktioner er:

• hierarkisk organisation af referencerne med brugerdefinerede taster
• designet for et miljø med flere brugere (del databaser mellem brugere)
• en søgemotor der understøtter live forespørgsler
• adgang til PubMed på internettet
• import af PubMed- (Medline), EndNote/Refer, RIS- og BibTeX-poster.

Bibus vil bruge en SQLite-database som standard for lagring (via SQLite3-modulet som er tilgængeligt i Python >2.5). Men den understøtter også MySQL-databaser. Hvis du ønsker at bruge en MySQL-database, så vær sikker på, at du har pakken python-mysqldb installeret.

Et program til at håndtere bibliografidatabaser i BibTeX-formatet. KBibTeX kan anvendes som et enkeltstående program, men kan også indlejres i andre KDE-programmer (f.eks. som bibliografiredigeringsværktøj i Kile).

KBibTeX kan søge i onlineressourcer (f.eks. Google Scholar) gennem tilpasselige søge-URL'er. Det kan også importere komplette datasæt fra NCBI Pubmed. Det understøtter desuden referencemarkering med nøgleord og håndterer referencer til lokale filer.

BibTeX-filer kan eksporteres til formater som HTML, XML, PDF, PS og RTF gennem en række citationsformer.

QQman er en udvidelsespakke for det statistiske miljø R. Denne pakke tilbyder funktioner for visualisering af Genome-Wide Association Studies-resultater (GWAS) via Manhattan-plot og Quantile-Quantile-plot.